Udledninger af næringsstoffer (kvælstof og fosfor) til havet kan føre til eutrofiering. Eutrofiering betyder, at produktionen af planteplankton øges som følge af udledningen. Det har negativ betydning for iltindholdet og lysets evne til at trænge igennem til planterne.
Der er altså en sammenhæng mellem udledningen af næringsstoffer og mængden af planteplankton i de danske farvande.
Tilførslen af kvælstof og fosfor til kysterne omkring Danmark opgøres årligt af Aarhus Universitet. Opgørelsen er baseret på data fra målestationer i vandløbene samt oplysninger om udledningen fra direkte udledninger (punktkilder), eksempelvis kommunale renseanlæg. For oplande, hvor det ikke er muligt at måle, beregnes tilførslen af total-kvælstof ved brug af simple modeller for tilførsel og omsætning af kvælstof i overfladevandssystemet.
Marine vandområder er også presset af andre faktorer, som kan have betydning for tilstanden, f.eks. fiskeri, råstofindvinding, klapning, klimaforandringer, invasive arter m.m